NGS Core
BIO CORE CENTER

차세대 염기서열 동정법에 기반한 실험 및 관련 연구 분야는 지속 확대 추세로 현대 생물학의 핵심 기술로 자리잡고 있으며, 차세대 염기서열 동정법을 활용한 후성유전체/전사체/유전체 연구는 생명 현상의 핵심 원리인 지놈을 포괄적으로 이해하는데 핵심 정보를 제공하고 있습니다. 현재 NGS 기반의 후성유전체/전사체/유전체 연구분야는 계속해서 신규 기술이 개발되고 적용 범위가 확대되고 있는 추세로 전통 생물학의 다양한 분야와 접목하여 매우 가파르게 확장되고 있는 분야입니다. 대용량 염기서열동정 코어가 없이 외부 업체에 의존하는 경우에는 라이브러리 제작과 염기서열 동정 그리고 생물정보학 분석사이의 전환 유연성이 낮아서 연구 효율성이 떨어지게 되므로 카이스트 NGS 코어에서는 이러한 단점들을 보완하여 유전체/후성유전체 분양에서 세계수준의 경쟁력을 갖추기 위한 중요한 발판을 제공할 것으로 예상됩니다.
NGS코어에서는 대용량 염기서열 동정 및 분석 코어를 구축하여 장비 및 전문 인력을 확보하여 운영하고 있으며, Illumina 염기서열 분석장비에 적합한 구조의 library prep 서비스와 RNA-Seq data 분석 서비스 또한 제공하고 있습니다.
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DNA서열분석기
High-throughput next-generation sequencing system
NextSeq550, Illumina
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DNA 특정 유전자 서열분석기
DNA Target Gene Sequencer
MiniSeq, Illumina
TruSeq Stranded mRNA single index library prep kit
NextSeq550 system performance parametersNextSeq550 | Total read | read length | Output | Run time | Data quality |
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High-output | 400 Million | 150bp | 50~60Gb | 18 hours | 80%>Q30 |
Mid-output | 130 Million | 150bp | 16~19Gb | 16 hours |
NextSeq550 | Total read | read length | Output | Run time | Data quality |
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Mid-output | 8 Million | 300bp | 2.1~2.4Gb | 17 hours | 80%>Q30 |